Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Tsr1Q5SWD9 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Tsr1Q5SWD9 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Tsr1Q5SWD9 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Tsr1Q5SWD9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Tsr1Q5SWD9 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms