Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Usp48Q3V0C5 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp48Q3V0C5 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms