Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Rnf40Q3U319 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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