Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Rnf149Q3U2C5 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnf149Q3U2C5 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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