Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms