Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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