Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VdrP48281 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VdrP48281 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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