Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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F11rO88792 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.53□□□□□ -2
F11rO88792 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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