Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ChkaO54804 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ChkaO54804 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ChkaO54804 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ChkaO54804 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ChkaO54804 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms