Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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Nedd9O35177 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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