Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ArxO35085 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ArxO35085 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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ArxO35085 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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ArxO35085 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ArxO35085 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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ArxO35085 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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ArxO35085 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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