Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn34c3J3QJW5 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms