Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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Gm340F6RGI3 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm340F6RGI3 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms