Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
NebE9Q1W3 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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