Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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