Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm4T1NXB5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm4T1NXB5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms