Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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