Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms