Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms