Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nup160Q9Z0W3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup160Q9Z0W3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms