Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms