Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VapaQ9WV55 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms