Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scnn1bQ9WU38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms