Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms