Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NrkQ9R0G8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NrkQ9R0G8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms