Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms