Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf4Q9QZS2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf4Q9QZS2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms