Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms