Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk1nQ9QXV0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms