Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354bQ9QXT9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354bQ9QXT9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms