Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a1Q9QX15 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms