Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms