Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms