Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln8Q9QUK3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms