Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfmbt1Q9JMD1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms