Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp1Q9JLK7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms