Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tgm1Q9JLF6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tgm1Q9JLF6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tgm1Q9JLF6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms