Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorcs1Q9JLC4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorcs1Q9JLC4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorcs1Q9JLC4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorcs1Q9JLC4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms