Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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