Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole3Q9JKP7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms