Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms