Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms