Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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