Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efcc1Q9JJF6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms