Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms