Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc86Q9JJ89 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc86Q9JJ89 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms