Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sv2aQ9JIS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sv2aQ9JIS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sv2aQ9JIS5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2aQ9JIS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms