Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prmt1Q9JIF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prmt1Q9JIF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms