Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms