Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms